Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms