Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVV-2B6SEH9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms