Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
HDGFL3Q9Y3E1 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HDGFL3Q9Y3E1 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms