Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms