Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCE1Q969G3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms