Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
BHLHE22Q8NFJ8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BHLHE22Q8NFJ8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
BHLHE22Q8NFJ8 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
BHLHE22Q8NFJ8 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms