Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPCAT1Q8NF37 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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