Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18A3Q16572 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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