Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ZFHX3Q15911 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ZFHX3Q15911 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ZFHX3Q15911 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ZFHX3Q15911 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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