Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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