Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUCB1Q02818 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms