Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ERVFC1-1P60608 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms