Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNB3P54284 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms