Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDC27P30260 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDC27P30260 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms