Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRGP23470 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRGP23470 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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