Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
XBP1P17861 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XBP1P17861 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XBP1P17861 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
XBP1P17861 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
XBP1P17861 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms