Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms