Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms