Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ABCB6Q9NP58 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ABCB6Q9NP58 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms