Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 APEX1-210ENST00000555414 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 OTOR-201ENST00000246081 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK17-202ENST00000542666 1769 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 XIAPP2-201ENST00000527404 1852 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF714-210ENST00000620627 2066 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR5D18-201ENST00000333976 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP87-201ENST00000364096 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092587.1-201ENST00000410042 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM180A-202ENST00000415751 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL023755.1-203ENST00000422253 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 YRDCP2-201ENST00000424606 642 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4A1P10-201ENST00000428832 1216 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 LDHAP3-201ENST00000448312 1008 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092042.1-201ENST00000457115 509 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms