Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PACSIN1Q9BY11 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms