Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HERC6Q8IVU3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms