Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TCF23Q7RTU1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms