Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SSPNQ14714 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SSPNQ14714 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SSPNQ14714 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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SSPNQ14714 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SSPNQ14714 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SSPNQ14714 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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