Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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FOXE3Q13461 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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