Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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FOXO1Q12778 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXO1Q12778 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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