Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNA1Q09470 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms