Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPN11Q06124 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms