Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DEFA6Q01524 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms