Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ERVS71-1P61550 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms