Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACADSBP45954 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms