Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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TNFSF9P41273 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFSF9P41273 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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