Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPREP23469 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTPREP23469 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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