Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RLBP1P12271 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms