Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZBED1O96006 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZBED1O96006 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZBED1O96006 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZBED1O96006 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZBED1O96006 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZBED1O96006 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZBED1O96006 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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