Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SOBPA7XYQ1 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SOBPA7XYQ1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SOBPA7XYQ1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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