Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
XIRP2A4UGR9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XIRP2A4UGR9 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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