Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 CARMN-205ENST00000518014 5131 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
A4D1N5 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 ADAMTSL1-201ENST00000276935 2906 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 TWNK-201ENST00000311916 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
A4D1N5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms