Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TARSL2A2RTX5 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms