Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNPO3Q9Y5L0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO3Q9Y5L0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO3Q9Y5L0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms