Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
WASHC2CQ9Y4E1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
WASHC2CQ9Y4E1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
WASHC2CQ9Y4E1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms