Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRG3Q9Y2Y8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRG3Q9Y2Y8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms