Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF5Q9Y2D1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF5Q9Y2D1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ATF5Q9Y2D1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF5Q9Y2D1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms