Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GINS2Q9Y248 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GINS2Q9Y248 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS2Q9Y248 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms