Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CEP164Q9UPV0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CEP164Q9UPV0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CEP164Q9UPV0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CEP164Q9UPV0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CEP164Q9UPV0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CEP164Q9UPV0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CEP164Q9UPV0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CEP164Q9UPV0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CEP164Q9UPV0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CEP164Q9UPV0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms