Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SRPK3Q9UPE1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPK3Q9UPE1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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