Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNRF3Q9ULT6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNRF3Q9ULT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms