Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO4Q9UKT5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO4Q9UKT5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO4Q9UKT5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms