Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ADAM28Q9UKQ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ADAM28Q9UKQ2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms