Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTNAP2Q9UHC6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTNAP2Q9UHC6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms